Abstract:
RESUMEN: La enfermedad de Chagas es actualmente un problema de salud pública en América
Latina, se consideran entre 6 a 7 millones de infectados principalmente en esta área y
algunos casos en Norte América, Europa, Japón y Australia. El tratamiento de la
enfermedad está limitado a dos fármacos benznidazol y nifurtimox los cuales tienen
efectos secundarios adversos que muchas veces resultan en el abandono de tratamiento.
Se han buscado estrategias de tratamiento alternas hacia blancos exclusivos del parasito,
entre los que destaca tripanotiona reductasa (TR). La enzima TR es esencial para el
sistema óxido-reducción participando en la detoxificación de las especies reactivas.
Distintas investigaciones reportan que el bloque de construcción de quinoxalina-1,4-di N-óxido tiene una actividad promisoria, aunque inespecífica, hacia la inhibición de TR.
En este estudio se realizó un diseño racional, a través de un análisis de acoplamiento
molecular, de derivados de quinoxalina-1,4-di-N-óxido utilizando tres bibliotecas como
fuente de moléculas: literatura, base de datos ZINC15 y análogos a quinoxalina-7-
carboxilato-1,4-di-N-óxido. Los resultados fueron analizados y los 10 mejores
compuestos de cada biblioteca analizados en sus interacciones con los aminoácidos de la
enzima con el programa PLIP entre los que destacan las interacciones con Glu466,
Glu467, His461 los cuales son aminoácidos importantes de interacción con el sustrato
natural. Doce nuevos derivados de n-butil-quinoxalina-7-carboxilato-1,4-di-N-óxido
fueron sintetizados y elucidados estructuralmente mediante espectroscopia de infrarrojo,
resonancia magnética nuclear y cromatografía liquida de ultra eficiencia acoplado a
espectrometría de masas. Posteriormente, la actividad tripanocida de cada uno de los
derivados sintetizados fue evaluada en un modelo in vitro sobre epimastigotes y
tripomastigotes de la cepa NINOA de Trypanosoma cruzi. El compuesto QX12 mostró la
mejor actividad tripanocida a la concentración de tamizaje y su concentración letal media
fue determinada, 4.41 μg/mL, por lo que se seleccionó para estudios posteriores.
Finalmente, se evaluó el efecto del compuesto QX12 sobre la expresión del gen de TR en
paralelo con la expresión del gen normalizador GADPH y se encontró que inicialmente la
expresión relativa (TR-GADPH) se redujo para luego reestablecerce a un nivel basal lo
cual sugiere una actividad no dirigida específicamente sobre la enzima TR.
ABSTRACT: Chagas disease is currently a problem of public health in Latin America, it is considered
that there are about 6 to 7 million infected, mainly in this area and there have been cases
reported in North America, Europe, Japan and Australia. The treatment for the disease is
limited to two drugs, benznidazole and nifurtimox which exhibit adverse secondary
effects that many times result in the abandonment of treatment. Alternative treatment
strategies have been sought out by targeting exclusive parasite enzymes, among which
trypanothione reductase (TR) has stood out. Trypanothione reductase is essential to the
parasite redox system since it participates in the detoxification of various reactive species.
Multiple studies report that the quinoxaline-1,4-di-N-oxide scaffold has a promising
activity, though unspecific, towards the TR inhibition. In this study a rational design of
derivatives of quinoxaline-1,4-di-N-oxide was carried out through a molecular docking
analysis, this analysis was done utilizing molecules from three sources: literature, ZINC15
database and quinoxaline-7-carboxylate-1,4-di-N-oxide analogs. The results were
analyzed and the 10 best resulting compounds from each library were analyzed to
determine their interactions with the enzyme amino acids utilizing the PLIP software,
among these interactions those with Glu466, Glu467 and His461 stood out since these are
important interactions with the TR natural ligand. Twelve new derivatives of n-butyl quinoxaline-7-carboxylate-1,4-di-N-oxide were synthesized, these were structurally
elucidated utilizing infrared spectroscopy, nuclear magnetic resonance and ultra performance liquid chromatography coupled to mass spectrometry. Further on, the
trypanocidal activity of each of the derivatives synthesized were evaluated in an in vitro
model for epimatigotes and trypomastigotes of the NINOA strain of Trypanosoma cruzi.
The compound QX12 showed the best trypanocidal activity at the screening
concentration, its lethal concentration 50 was determined, 4.41 μg/mL, so it was chosen
for further testing. Lastly, the effect of the compound QX12 over the expression of the
TR gene was evaluated in parallel with the expression of the GADPH gene, it was found
that initially the relative expression (TR-GADPH) was reduced but it was then regained
and stabilized at a basal level which suggest that its mode of action is not specific to an
effect over TR.
Description:
Tesis (Maestría en Ciencias en Biotecnología Genómica), Instituto Politécnico Nacional, CBG, 2019, 1 archivo PDF, (121 paginas). tesis.ipn.mx